正置荧光显微镜主要用于观察普通染色组织细胞及荧光标记物等应用领域，配备成像系统将图像和视频呈现在电脑显示器，是生物学，细胞学，遗传学，免疫学等研究工作的理想仪器。可供科研、高校、医疗、防疫和农牧等部门使用。
在植物细胞的观察研究中，通过染色可以更清晰地观测到细胞的形态及结构。倒置荧光显微镜特别适用于对活体细胞和组织、流质、沉淀物等进行显微研究，可对圆筒状烧瓶或高培养皿进行无沾染培养细胞观察。可检查和定位病毒、细菌、霉菌、原虫、寄生虫及动物和人的组织抗原与抗体，可用以探讨病因及发病机理，染色观察，结构分析，是生物学，细胞学，肿瘤学，遗传学，免疫学等研究工作的理想仪器。
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